Клэр и её команда снова угодили в переплёт. Их самолёт попал в жуткую грозу и потерпел крушение на необитаемом острове посреди океана. Очнувшись, наши герои отправились на поиски помощи. Недолго скитаясь, Клэр вышла к деревне, местные жители которой представились атлантами и попросили помочь им вернуть свою родину, а также проучить злого правителя подводного мира.